胸外科创立于1976年，2016年成立胸外中心，分设两个病区，一病区重点收治非结核病人，特别是胸部肿瘤；二病区重点收治结核手术病人，后期还将增设重症监护病区。病区开放床位130张，共有医师15名，其中主任医师3名，副主任医师3名，主治医师8名，住院医师2名。共有护理人员29名，其中副主任护师1名，主管护理师3名，护理师8名，护士17名。科室特色开展肺叶、肺段及全肺切除术、肺癌根治术、胸廓成形术、胸膜剥脱术、肺减容术、肺大泡及肺部分切除术、胸壁重建术、支气管动脉结扎术、纵隔淋巴结清除术、纵隔肿瘤切除术、食道良性病变切除术、食道癌根治术。在2009年率先在全疆开展了胸腔镜肺叶切除术，此后又相继在全疆率先开展了胸腔镜肺段、全肺以及单孔、剑突下切口手术、肺叶袖式等各类复杂胸腔镜手术，很多技术位于西北领先水平，目前是西北地区胸腔镜培训基地。在胸部结核外科方面，针对其复杂难点问题，如大咯血、慢性脓胸、支气管胸膜瘘、纵隔淋巴支气管瘘、毁损肺等方面，经过多年实践摸索均取得了突破性进展。如胸腔镜支气管动脉结扎术，解决了咯血病人肺功能差无法耐受肺切除手术的问题；开窗分期手术解决了慢性脓胸问题；带蒂肌瓣移植解决了支气管胸膜瘘的问题；纵隔淋巴结核提前干预，解决了纵隔淋巴结结核气管支气管瘘的问题；毁损肺行全肺切除术肺功能最低值达到第一秒量0.79L，挑战了全肺切除极限。在胸部肿瘤方面，科室力求快速诊断、微创、精准、规范治疗。在诊断方面，对实验室检查、影像学检查，无法确诊病例，科室积极通过EBUS-TBNA、经皮肺穿刺、腔镜活检等微创手段，