自治区妇幼保健院儿童保健一科是乌鲁木齐市级重点专科，已拥有60多年的建科历史，集医疗、保健、教学、科研为一体，担负着全区儿童保健业务的管理、规划、指导、培训的工作，并为全区儿童提供全方位、多层次的优质服务。科室拥有雄厚的技术力量、先进的技术设备，服务内容涵盖整个儿童儿童期（0-18岁）的体格发育、营养发育和心理行为发育。科室位于南楼三楼，区域面积1500m2，设有：生长发育、儿童营养、儿童心理、高危儿管理、体弱儿管理、儿童口腔保健、儿童潜能开发、育儿学校等二级学科。特色门诊有：早产儿出院后管理、婴幼儿过敏防治、新生儿黄疸、营养评估、身高促进、小儿内分泌疾病诊治、儿童龋病治疗等。配置的先进技术设备包括：骨密度测量仪、体成分分析仪、母乳分析仪、注意力分配能力测定仪、过敏风险评估智测系统、儿童营养分析软件、儿童早期发展感统体系等一批先进设备。医护团队结构合理，全科医护人员共22人，其中主任医师3人、副主任医师3人、主治医师6人、医师1人、护士8人、幼教1人。其中2人为研究生学历，15人为本科学历。2016年门诊量约70700余人次。儿童保健科主持市级、局级科研项目3项：1、《乌鲁木齐市汉族儿童CAREY气质常模及类型分布的研究》2、《乌鲁木齐市学龄前儿童过敏性鼻炎流行病学调查》3、《对乌鲁木齐市妇幼保健院儿保门诊儿童先天性心脏病的筛查》。院级科研项目一项：《早产儿出院后生长发育监测与随访》。参加国家级科研项目3项：1、《早产儿出院后管理》2、《儿童过敏干预项目》3、《中国TIMP全国标准化取样》。国内核心期刊发表论文十余篇。发表论文有:《乌鲁木齐市1个月-7岁儿童CAREY气质系列问卷基础数据研究》、《过敏性鼻炎药物治疗的新进展及注意事项》、《乌鲁木齐3-7岁儿童过敏性鼻炎患病情况研究》、《乌鲁木齐市3-7岁过敏性鼻炎患儿过敏原检测分析》、《乌鲁木齐市一级幼儿园3-6岁儿童血红蛋白水平分析》、《几种主要骨龄测定方法在我国的应用进展》、《乌鲁木齐市20所幼儿园3-6岁儿童龋齿患病率调查》、《乌鲁木齐3-36月龄儿童先心病监测分析》等。