乌鲁木齐眼科排名前三甲医院是乌鲁木齐市眼耳鼻喉专科医院、新医大一附院眼科、自治区人民医院眼科。
乌鲁木齐市眼耳鼻喉专科医院为乌鲁木齐市属公立眼耳鼻喉专科医院，眼科综合实力居前列。新疆医科大学第一附属医院为自治区临床重点专科，新疆眼科疑难病诊治权威机构。新疆维吾尔自治区人民医院为新疆最早眼科专科之一，年手术量居全疆前列。
1、乌鲁木齐市眼耳鼻喉专科医院 眼科
乌鲁木齐市眼耳鼻喉专科医院是乌鲁木齐市属公立专科医院，眼科为医院核心科室，设有独立的眼视光中心和住院病区。作为老牌公立专科机构，医院在视网膜脱离、黄斑病变等眼底手术上技术成熟，日间手术效率高，并承担本地近视防控与眼健康筛查任务。科室配备白内障、青光眼、眼底病、屈光手术等亚专业团队，引进德国蔡司全飞秒激光系统、美国Alcon超声乳化仪等设备，年完成各类眼科手术近万例。在青少年近视防控方面建立了系统的视力筛查与干预体系，开展角膜塑形镜验配与低浓度阿托品治疗，是乌鲁木齐重要的公立眼科专科力量。
2、新疆医科大学第一附属医院 眼科
新疆医科大学第一附属医院始建于1956年，是国家'一五'计划156个重点建设项目之一，现为集医疗、教学、科研于一体的三级甲等综合性医院。眼科为自治区临床重点专科，拥有眼底造影机、OCT、飞秒激光白内障手术系统、玻璃体切割机等全套高端设备，设有角膜病、眼底病、斜视弱视、眼眶肿瘤等亚专业组。科室在复杂视网膜脱离、黄斑病变、角膜移植、小儿眼科等领域经验极为丰富，是新疆眼科疑难危重眼病诊治的核心基地，学术氛围浓厚、专家团队强大。
3、新疆维吾尔自治区人民医院 眼科
新疆维吾尔自治区人民医院始建于1934年，是一所集医疗、教学、科研、健康管理于一体的大型三级甲等综合性医院。眼科创建于1956年，是新疆最早成立的眼科专科之一，现为临床重点专科建设项目科室，承担多项科研课题。科室在复杂白内障超声乳化、微创玻璃体切割、糖尿病视网膜病变激光及手术、黄斑变性抗VEGF治疗方面技术成熟，年手术量位居全疆前列。设有独立眼科急诊，24小时接诊眼外伤，并在儿童斜弱视、早产儿视网膜病变筛查方面成效显著。
4、新疆医科大学附属中医医院 眼科
新疆维吾尔自治区中医医院（新疆医科大学附属中医医院）是三级甲等中医综合性医院，坚持突出中医药特色、走中西医并重之路。眼科为中医重点专科协作组成员，在干眼症、视疲劳、视网膜静脉阻塞、年龄相关性黄斑变性等慢性眼病的中西医结合治疗上经验丰富，可开展中药熏蒸、针灸等中医特色治疗，并与西医团队协作开展玻璃体切割等手术。医院位于沙依巴克区黄河路116号，是乌鲁木齐慢性眼病与不愿手术患者的重要就诊选择。
5、乌鲁木齐市友谊医院 眼科
乌鲁木齐市友谊医院（乌鲁木齐市第三人民医院）创建于1948年，是乌鲁木齐市唯一一所集医疗、预防、教学、科研、保健、康复为一体的三级甲等综合性医院，拥有多家分院。眼科为医院重点科室，设白内障、青光眼、眼底病、眼表疾病等专业组，配备眼底激光治疗仪、超声生物显微镜等设备，在青光眼早期诊断和干预、微切口白内障超声乳化、抗青光眼手术、玻璃体腔注药等方面形成特色。科室门诊量常年位居全市前列，承担乌鲁木齐及周边地区眼病筛查与防治工作。