火箭军特色医学中心胃食管外科由中国科学院汪忠镐院士创建于2006年4月，以吴继敏教授为学科带头人，是国内唯一一家独立建科的胃食管反流病专病科室，拥有床位30张。科室团队多数拥有硕士以上学历，技术精湛，服务优良。科室拥有Medi射频治疗仪、24小时食管pH-阻抗检测仪、24小时Dx-PH咽喉反流检测仪、高分辨率食管测压、经皮胃动力、高清胃镜等各种国际上最先进的胃食管反流病专科诊疗设备。科室以腹腔镜下胃底折叠术和胃镜下贲门微量射频治疗为主要治疗特色，结合规范化的药物和物理治疗，对胃食管反流病进行全方位研究，目前已开展胃底折叠术3600余例，射频治疗近2100余例，形成规模化和专业化效应，其数量遥遥领先于国内，疗效显著，并建立了规范的胃食管反流病的诊断和治疗流程，继续推动学科的发展。科室开展以贲门为中心的胃食管反流相关疾病的微创治疗，如贲门失弛缓症、胆汁反流性胃炎、十二指肠淤积症、贲门切除或胃大部切除等外科手术后严重反流等。科室以胃食管反流引起的咳嗽、哮喘、喉痉挛等食管外症状为主要的研究和治疗对象，秉承汪院士建科的初衷，发现和救治那些长期被误诊的反流性"哮喘"的患者，使人们对胃食管反流呼吸道侵袭所致呼吸道疾病的认识发生了质的飞越。另外，科室还积极开展学术和科普推广工作，先后承办了国际、国内及北京地区专业学术会议10余次，定期召开患友会，发表胃食管反流病相关文章100余篇，编著5部。