肛肠外科于2014年建科，隶属普通外科系列，科室梯队建设完善，为海南南部广大肛肠病患者提供优秀技术、优质服务、高度专业化的肛肠病治疗专科，是海南南部区域技术力量最强的肛肠专科之一。科室采用中西医结合，专业治疗痔疮、肛裂、肛瘘、肛周脓肿、直肠脱垂（脱肛）、顽固性便秘、肠炎、先天性肛门直肠畸形、肛门狭窄、肛门失禁、肛周皮肤病、结肠直肠良、恶性肿瘤等多种大肠、肛门疾病。科室开设了肛肠专科门诊，由正副主任医师等专家以及由专业医护人员组成的医疗队伍，为专科临床治疗提供了一流的技术保障。先进的诊疗技术一、在三亚市率先采用PPH及TST技术微创治疗重度痔疮及其它肛门直肠疾病。二、与普通外科联合，采用腹腔镜技术治疗直肠癌，治愈率高又能兼顾病人的生理功能。