马巷卫生院创建于1958年，前身是1954年成立的同安县第一个联合诊所--第八区中医联合诊所。马巷卫生院址设马巷镇舫阳西二路391—399号，占地面积5415平方米，其中建设用地面积4828㎡，总建筑面积5823.5㎡。马巷镇辖区面积66.67平方公里，辖36个社区，99个自然村，户籍人口10.2万，外来人口9.8万，马巷卫生院总服务人口约20万，居全区之首。马巷卫生院承担马巷镇基本医疗服务和基本公共卫生服务任务，完成重大妇幼公共卫生任务、政府临时指令性任务（如拆迁、各类重要考试、大型活动等医疗保障）及突发公共卫生事件处置。卫生院主要工作职责包括：（一）承担辖区内社区居民（户籍人口和外来人口）14类的基本公共卫生服务项目（含：建立居民健康档案、健康教育、预防接种、儿童健康管理、孕产妇健康管理、老年人健康管理、慢性病患者健康管理（高血压、糖尿病）、严重精神障碍患者管理、结核病患者健康管理、中医药健康管理、传染病和突发公共卫生事件报告和处理、卫生计生监督协管、免费提供避孕药具、健康素养促进行动）。（二）落实叶酸发放、"两癌"筛查等妇幼重大公共卫生服务项目。（三）全面推进分级诊疗，扎实开展家庭医生签约服务。为社区居民提供基本医疗服务，包括常见病、多发病的诊疗，中医药服务，常规简单的生化检查、X线、心电图、超声检查，康复治疗，转诊等。（四）受区卫生行政主管部门的委托，承担辖区范围内的公共卫生管理工作，负责对村级卫生的管理和技术指导以及乡村医生的培训。（五）参与政府指定的医疗保障，以及防灾减灾救护工作任务。马巷卫生院编制数126人，现有编内在职人员90人，其中研究生学历5人，本科学历51人；卫生技术人员75人：其中：副高级职称9人，中级职称36人。临时聘用人员29人。核定床位数50张。马巷镇有社区卫生所31所，乡村医生94人。现有科室设置：设预防保健科、全科医疗科、内科、外科、妇产科（妇科专业、计划生育专业）、妇女保健科、儿科、儿童保健科、耳鼻咽喉科、口腔科、皮肤科、精神科、医学检验科、医学影像科、中医科（中医疮疡专科、中医外科、中医骨伤科、中医内科）。医疗设备：DR、X光机、B超、彩超、心电图、心电监护仪、全自动生化分析仪、全自动五分类血液分析仪等。