中医科创办于1988年，历经近30年发展，现有医务人员28人，其中主任医师4名，副主任医师5名，博士3名，硕士6名。科室由门诊、住院部组成，集医疗、教学、科研为一体，核定病床位42张，床位使用率达100%以上，治愈好转率98%，年出院1000人次以上，年门诊量14万以上。中医科自开科以来，秉承提高医疗服务质量，保证医疗安全，发挥中医特色为理念，积极开展中医药传统和中西医结合治疗，弘扬中医辨证论治、整体观念精神，结合现代医学研究，运用中医辩证与现代辨病相结合的诊疗方法，以扶正祛邪、调节人体阴阳平衡为手段，治疗各种常见病、多发病及某些疑难杂症，逐步形成了以中医、中药、养生、康复为一体的中医特色治疗体系。科室注重传承和发展，顺应医学发展趋势，积极开展优质医疗护理，体现人文关怀，始终贯彻"一切以病人为中心"的服务宗旨，临床疗效显著，患者满意度高，受到患者及家属的一致好评。特别是在慢性病、老年病、肿瘤性疾病、心脑血管疾病、脾胃病、妇科疾病、颈肩腰腿痛上，采用中西医结合治疗方案，多靶点作用，提高临床疗效，为患者解决了不少疾苦；对于慢性病如高血压、糖尿病、肿瘤手术放化疗后等症状改善、提高生活质量和时间等方面及并发症的预防均取得良好的疗效。许多病人包括泉州、漳州、闽西南地区，远至世界各地华侨和外宾也慕名前来治疗，并积累了良好声誉。    科室在注重临床诊疗的同时，也积极开展具有中医特色的教学、科研工作，承担厦门大学医学院中医系及福建中医药大学研究生、本科生及海外生教学和实习任务，在全国和省级以上医学杂志发表论文百余篇，多篇论文被国际权威SCI、Medline收录，并多次荣获各类奖项。科室主持承担国家自然科学基金面上项目、福建省重点科技项目、福建省中医药科研项目、厦门市科技项目等科研工作。由于科室医护团结，工作成绩显著，医疗安全保证，多次被评为"先进集体"等光荣称号，2013年被卫生部和国家中医药管理局评为"全国综合医院中医药工作示范单位"，2019年被福建省卫健委授予"福建省中西医结合老年病"重点专科建设单位，学科带头人黄源鹏主任医师也被评为"全国优秀中医临床人才"。