中医科于1974年建科，迄今已40余年。多年来，中医科在临床、科研、教学工作中取得较大的成绩。中医内科开展专科专病（内科、妇科、皮肤科、男科，及乳腺病、泌尿系统病、脾胃病、心脑血管病、肝胆疾病、糖尿病等专病）的中西医结合诊断与治疗。中医内科现有在职及返聘中医医师9名。其中主任医师4名，副主任医师2名，主治医师2名，住院医师1名（其中硕士研究生学历3名）。在开展特色治疗的同时，还积极开展教学科研工作。1995年以来，中医科共荣获福建省科技厅、总工会科技二等奖一项、市级科技进步奖8项（其中二等奖2项，三等奖6项）。并承担福建医科大学本院分班的中医课程授课、福建中医药大学等本、专科实习带教、全科医师规培带教工作，及进修生的临床指导工作。