康复医学科成立于1994年12月，是福建省内最早成立的康复医疗机构，以脑血管病康复为重点的临床、科研、教学基地。1998年脑血管病康复治疗专业被评为福建省十大领先医疗特色专业之一。形成了完整的脑血管病现代康复与治疗体系，同时开展了颅脑外伤，脊髓损伤，小儿脑瘫，骨关节疾病等的综合康复。设有康复评定室、运动治疗室、作业治疗室、言语吞咽治疗室及医用高压氧室。拥有等速训练治疗仪，下肢康复机器人，经颅直流电刺激治疗仪，超声治疗仪，高、中、低频电治疗仪，温热磁疗仪，生物刺激反馈治疗仪，吞咽障碍治疗仪，语言治疗仪，医用高压氧舱及较完整的作业，运动治疗设备。开展了脑卒中急性期介入康复治疗，中枢神经损伤神经网络重建治疗，虚拟情景互动训练，等速肌力训练，言语和吞咽障碍评估与康复，认知功能障碍的康复，A型肉毒毒素治疗肌痉挛，脊髓损伤的综合康复，骨折术后、关节置换术后的康复，脑血管病现代康复护理等新技术。