晋江市医院病理科创立于1999年，至今已走过17个年头。经过几代病理人的不懈努力，病理科发展至今已成为集医疗、教学、科研三位一体，人才梯队合理、专业结构齐全的晋江市临床病理诊断中心。中心现有副主任医师1名，主治医师2名，住院医师4名，技师4名，其中在读研究生2名。病理中心肩负着本院及晋江市20几家医疗卫生单位的病理活检、手术中快速诊断、各种脱落细胞学检查、免疫组织化学检查。对内、外、妇、产、儿、耳鼻喉、眼科、皮肤科等各临床科室的各种疾病进行病理诊断和病因分析，其中最主要的工作是对肿瘤进行病理分型、分级和预后分析。目前的年外检量约15000例，细胞学检查约10000例，免疫组化约5000项，冰冻切片约350例。科室目前规划整洁，分区合理，拥有取材室、脱水室、细胞室、冰冻切片室、包埋室、制片及染色室、免疫组化室、图文报告室、诊断室等，拥有一批先进的专业诊疗仪器设备，如英国珊顿冰冻切片机、德国莱卡全封闭自动脱水机及两台半自动切片机、日本产奥林巴斯BX系列生物显微镜、计算机彩色病理图象分析系统及病理远程会诊系统等。目前开展的项目，除常规石蜡切片诊断、术中快速冰冻诊断、液基细胞病理学检查外，还开展各种免疫组化染色、特殊染色等项目来协助进行病理鉴别诊断，涵盖三级医院所需的项目，并计划开展分子病理检测，病理质控达到福建省质控标准。中心新开展骨髓活检病理诊断技术，该技术填补了我市医疗空白。病理中心人员努力钻研业务水平，参与各临床科室的相关科研活动，同时也积极参与外院专业学术交流活动，目前发表国家级论文20余篇，参与市级科研一项。