口腔科是医院创院科室之一，伴随医院历史变迁，不同阶段的口腔科主任黄飞、陈亦珊、郭平山分别是闽侯专区、莆田地区、莆田市口腔医学的学科带头人，历届本地区、市的口腔科学组、学会均挂靠本科。科室现有医生12人，其中有7人任福建省口腔医学会各专业委员会常务委员、委员，科主任为福建省口腔医学会常务理事、莆田市口腔医学会会长。科室全面承担口腔医学临床、教学、科研、预防、保健等任务，是全市唯一的一家口腔科开设二级学科，下设四个二级专科----牙体牙髓及儿童、预防，口腔修复，口腔正畸，口腔外科及牙周种植，四个二级学科带头人均在中国一流的口腔医学院（北京大学、上海交大、第四军医大学、华西医大）本专业进修一年以上，为市内该专业的领军人物；其中口腔颌面外科在我市享有盛誉。