急诊科于1960年组建，承担着全市大部分急危重症病人救治及邻近县的三级转诊任务,是国家级住院医师规范化培训急诊专业基地，并承担福建医科大学急诊专业课程的教学任务，是集临床、科研、教学为一体的综合性科室。急诊门诊设有内科急诊、外科急诊、儿科急诊、神经科急诊，年急诊量51000余人次，年抢救病人6400余人次，抢救成功率达99%以上。