省立医院消化内镜中心是福建省消化内镜中心、福建省医学会消化内镜学分会挂靠单位，是福建省规模最大的内镜中心，是中华医学会消化内镜学分会的培训基地，每年培养福建省各地消化内镜医师数十名。本中心拥有最先进、最齐全的消化内镜诊疗系统，引进Olympus高清胃肠镜、放大胃肠镜、电子染色内镜、超声内镜、十二指肠镜、小肠镜及Given胶囊内镜系统。本中心医师具有精湛的技术、丰富的经验，每年完成消化内镜诊治量达到6万余例次，居我省首位。我中心开展的内镜诊疗技术在福建省消化内镜中处于领先地位，与国内外消化内镜的发展保持平行。福建省立医院消化内镜中心开展诊疗项目多，不仅开展急诊内镜、消化道异物取出术、消化道狭窄扩张术、消化道息肉切除术、内镜下止血术、消化道支架或营养管置入术、食管胃静脉曲张内镜治疗术等基本内镜治疗技术，同时在早癌诊疗、ERCP、EUS、小肠疾病、小儿内镜等方面开展大量工作。