协和医院血液科是省"211工程"重点学科——福建省血液病研究所的临床部分，是内科学（血液病）博士点、临床医学博士后流动站，同时也是省教育厅和卫生厅的重点学科，福建省血液医学中心、福建省血液病重点实验室和国家药品临床研究基地。2017年入选国家卫计委和国家食药监总局发布的第二批干细胞临床研究备案机构，为福建省唯一一家入选单位，2019获批成为以中国医学科学院血液病医院为依托单位的国家血液系统疾病临床医学研究中心的重要成员单位。先后有70多项成果获国家、省部级科技成果奖，其中3项分获国家科技进步奖及国家自然科学奖。在国内最早建立了人类T细胞白血病病毒感染（HTLV-Ⅰ）感染的检测和诊断方法，在国内首次发现有HTLV-Ⅰ流行区，成果获1997年度国家科技进步三等奖。连续八年进入"复旦版"全国最佳专科排行榜前20强。现有医技人员91人，其中高级职称29人，国家级专家3人，国家"百千万人才工程"第一、二层次人选1人，享受国务院政府特殊津贴5人，福建省优秀专家5人，博士生导师7人，硕士生导师17人。