协和医院胃外科创建于2010年，是国家临床重点专科，也是我国规模最大、医疗水平最高，集医疗、教学、科研为一体的胃癌外科诊疗中心之一。科室设有2个病区，总床位92张，年手术量超过1100台；科室技术力量雄厚,学术梯队健全，拥有主任医师4名，副主任医师5名，主治医师7名；教授4名、副教授4名；博士生导师4名、硕士生导师7名。科室建立起胃癌现代外科治疗新理念，总结出一套合理高效的胃癌综合治疗方案，以提高胃癌患者长期生存率；在福建省最早开展腹腔镜胃癌手术、机器人胃癌手术和微创减重手术。截止2020年已经累计完成超过8000例腹腔镜胃癌手术居国内第一，手术质量居国内领先地位。科主任黄昌明教授作为唯一来自中国的手术演示专家，连续两年受邀赴罗马参加意大利消化外科年会并进行现场腹腔镜胃癌手术演示。同时，在机器人手术方面也取得重要成果，累计完成500余例机器人胃癌根治术，并在国际上首次报道机器人对比腹腔镜胃癌手术的前瞻性随机对照临床试验（RCT）结果。此外，科室还开展多项创新性手术技术，在国际上首创腹腔镜胃癌脾门淋巴结清扫"黄氏三步法"、远端胃切除"改良三角吻合术"和全胃切除"延迟离断over-lap吻合术"，并在国际上率先以RCT证实吲哚菁绿（ICG）荧光标记在腹腔镜胃癌淋巴结清扫中的价值等，相关技术已经在国内外获得推广应用。科室拥有享受国务院政府特津贴专家、福建省突出贡献中青年专家、福建省科技创新领军人才等在内的高层次人才，曾入选中国名医百强榜全国"TOP10"。科室承担国家及省部级科研项目50余项，目前仍在研国家自然基金7项；在国内外核心期刊发表论文320余篇，其中SCI论文200余篇；出版5部中、英文专著；获包括福建科学技术进步奖一等奖在内的省部级科技成果奖12项。科室每年受邀在北京、上海、广州等地医院进行手术演示50余次，并全国各地医院会诊手术100余台，在全国范围内传授腹腔镜胃癌手术技术。科室先后主办12届"全国胃癌外科规范化治疗高峰论坛"和113期"全国腹腔镜胃癌淋巴结清扫高级培训班"，每年接收来自全国各地进修医生50余名，培训了国内大批胃癌微创外科医师，有力的推动了我国胃癌外科的发展。