耳鼻咽喉科是福建中医药大学附属第三人民医院与人民解放军联勤保障部队900医院（原福州总医院）耳鼻咽喉头颈外科共建科室，科室整合两个医院的优势资源，组建联合医疗团队，发挥中西医优势，旨在建成集医疗、教学、科研、健康管理为一体的耳鼻咽喉头颈外科学临床基地。科室技术力量雄厚，设备先进。科室以900医院耳鼻咽喉头颈外科陈贤明主任为学科带头人，目前拥有主任医师2名，副主任医师2名，住院医师2名，其中，医学博士3名，医学硕士2名。科室专科设备齐全，拥有纯音测听仪、声阻抗仪、电子鼻咽喉镜、视频支撑喉镜，鼻窦内窥镜、耳鼻咽喉科动力系统、低温等离子治疗系统、多导睡眠监测仪等先进设备以及超声中药导入治疗仪、电磁治疗仪等设备。目前科室开放专科床位15张，开展耳、鼻、咽喉、头颈常见病、多发病常规诊疗，在闽侯地区率先开展鼻内镜鼻腔鼻窦手术、视频支撑喉镜喉显微手术，低温等离子扁桃体、腺样体消融术及悬雍垂腭咽成形术，鼓膜修补术，乳突根治术等，填补闽侯地区空白。开展气管切开术，甲状腺、腮腺、颌下腺等头颈部位肿瘤切除术，头颈部淋巴结清扫术，颌面部骨折切开固定术，头面部缺损皮瓣修复术等，多项技术处于省内先进水平。配合特色诊疗项目有：中药鼻腔鼻窦灌洗，中药超声导入、外敷，针灸，穴位注射、穴位贴敷等，为专科疾病提供最佳的中西医结合诊疗方案。教学科研方面。科室承担福建中医药大学本科教学、实习临床带教任务，现承担省部级课题1项，厅级课题2项，在研福建中医药大学校管课题3项，发表核心论文10余篇，SCI2篇，授权医疗类国家实用新型专利、发明专利10余项。