针灸科成立于1958年，是福建省最早创立的针灸专科，是全国针灸临床研究中心福建省分中心，福建省中医重点专科，针灸专科联盟牵头单位，福建中医药大学硕士研究生培养点，是第二批国家中医药管理局临床研究基地重点病种（中风病）的主要承担科室。科室技术力量雄厚，现有医师人，其中福建省名中医、第五批全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师1人，全国优秀中医临床人才1人，国内名中医访问学者2人，硕士研究生导师3人，高级职称7人，博士1人。多名医师曾受国家委派赴国外学术交流，并在中国针灸学会、世界中医药学会联合会、中国中医药信息学会、福建省针灸学会担任副主任委员、秘书长、常务委员等。科室曾获省政府科技奖一项，先后承担省、部级以上科研课题10余项，其中国家级科研课题1项。科室由门诊、病房、梁栋富名老中医药专家传承工作室组成，病房开放床位42张。科室充分发挥中医特色优势，特色疗法鲜明，开展以针灸为主的特色疗法，如：小针刀、圆利针、脐针、腹针、穴位埋线、浅针、火针、头皮针、平衡针、腕踝针、梅花针、三伏灸、精灸、热敏灸、雷火灸、隔物灸、桑枝棒、药罐、中药熏洗、整脊等，治疗面瘫、中风、颈肩腰腿痛、膝痹、胃脘痛、腹泻、失眠、头痛、肥胖等疾病，疗效显著。同时依托国家临床研究基地，开展难治性面瘫、中风后认知障碍的临床研究，达到省内领先水平，专科影响力辐射至全省各地，知名度和认可度较高。