1985年前，临床医学工程部称"遵义市医疗器械修配所"。1986年，遵义地区医疗器械修配所与遵义地区医院（遵义市第一人民医院前称）供应科共同组建为"遵义地区医院医疗设备科"，主要负责遵义地区所属医疗机构的医疗设备维修、维护工作及本院的耗材及设备采购、库房管理、医疗设备维修、维护工作。2013年，与固定资产及物资管理科合并组成临床医学工程部。临床医学工程部负责本院医疗器械的运行、维修、维护及医用耗材的供应、使用、监测管理工作。日常工作实行模块化管理，分为设备维修管理、固定资产管理、医用耗材管理、医用气体供应站、办公室等。