西藏自治区藏医院眼科始建于1916年。从1930年开始由眼科中心专家及医护人员组成医疗队，奔赴西藏各地免费为白内障患者开展复明手术，并成功开展白内障针拨术（藏医传统手术诊法），使不少白内障患者重见光明，获得了百姓患者的赞誉。2018年挂牌为西藏自治区眼科中心，现已成为集医疗、教学、科研、预防及保健为一体的区内现代化大型眼科中心。眼科中心现有医护人员33名，其中主任医师1名，副主任医师2名，主治医师5名，住院医师5名，医学影像学2名，验光师3名，护师15名。为了人才队伍的建设，曾多次派遣医护人员到国内外著名眼科医院学习专业诊疗技术。并引进各种先进的诊疗技术，提升我院眼科临床和科研专业力度。眼科中心共设立眼科诊室5个，特检室3个，治疗室2个，床位52张。先后引进了全自动验光仪、眼科A/B型超生诊断仪、眼前段照相系统、眼底照相及荧光造影系统、非接触式眼压计、数码裂隙灯、电脑验光仪、YAG激光、眼底激光、角膜曲率计、A/B型超生诊断仪、眼底照像机、视野机、手术显微镜、超乳化治疗仪、玻切机等设备。已顺利开展白内障大小切口术、白内障超声乳化、斜视矫正术、青光眼、鼻泪管吻合术、泪囊摘除术、倒睑术、老年性上睑下垂矫正术、下睑内翻矫正术、翼状胬肉杆细胞移植术、斜视矫正术、眼内注药、视网膜光凝术等各类眼科手术。据不完全统计，2019全年眼科中心门诊量达8万人次，开展各种眼科手术6373例。西藏自治区藏医院眼科中心立足藏医药特色优势，挖掘和加强对传统藏医药各种眼科疑难常见疾病的研究，充分发挥藏医眼科诊疗技术和藏医眼科同现代眼科医学技术相结合的特殊作用，特别是对春卡、翼状胬肉、角膜云翳、眼底出血、黄斑病变、球后视神经炎、弱视等眼科疾病方面具有良好的疗效。西藏自治区眼科中心作为西藏自治区规模最大、仪器设备最先进、设置床位数量最多的现代化眼科中心，用技术和实力彰显了区域眼科中心的优势地位。同时发挥着大型公立医院"以病人为中心"医疗服务的主渠道作用，开展健康帮扶、培养基层眼科医生、参加西藏广播电视台藏语频道眼科知识宣讲、下乡专题讲座等活动，带动基层眼科服务能力提升和医疗服务同质化。2017年，与哈尔滨医科大学附属第一人民医院合作开展"西藏地区高原性白内障福明手术方案优化和相关机理研究"省级科研课题，赢得了业内的认可和患者的信赖，成为西藏眼科领域的"领头羊"。我院眼科中心，在自治区卫健委、援藏发展基金会、中华医学会眼科学分会、中国女医师协会眼科学分会、北大人民医院、北京同仁医院、汕头国际眼科医院、上海儿童医院、华中科技大学同济医学院附属同济医院、哈尔滨医科大学附属第一人民医院、北京同仁张晓楼眼科公益基金会等单位的大力帮助下，已取得了跨越式发展，也使得当地百姓患者能够享有与国际、内地同质的医疗服务。