心血管内科为西藏自治区重点专科及林芝市人民医院重点学科，广东省人民医院院包科科室，是全自治区地市级医院中唯一能够开展心血管介入和先天性心脏病介入治疗的学科。共有医师8名，其中主任医师1人，副主任医师2人，具博士学位者2名。设有心内科、心脏重症监护病区（CCU）、心电图检查室（包括普通心电图室、动态心电图室、动态血压检查室）、介入室等部门，开放病床共28张，是目前林芝市床位数最多、年住院病人数最多的心血管内科。心血管内科对高血压、冠心病、心脏瓣膜病、心力衰竭、先天性心脏病等心血管病进行高质量的诊断及治疗，并成功对多名心跳骤停的患者成功进行心肺复苏。心血管病介入室拥有数字减影血管造影机2台、多导电生理仪、除颤仪、主动脉内球囊反搏仪等，并正在采购血管内超声仪、冠状动脉血流储备测定仪等心血管专科设备，配置已达到自治区级医院水平。目前我中心已经西藏自治区市级医院首例冠状动脉造影及支架植入术及房间隔缺损封堵术，并开展西藏自治区市级医院首例经皮外周动脉造影/支架植入术。常规开展的心血管介入诊治项目包括冠状动脉、主动脉、外周动脉造影；左心、右心导管造影检查；择期及急诊冠状动脉介入治疗；心脏电生理检查；心脏起搏器植入术(单腔,双腔,埋藏式自动除颤起搏器)；主动脉内球囊反搏术；先天性心脏病介入治疗如室间隔缺损封堵术、动脉导管未闭封堵术等。医院率先建立了"林芝市胸痛诊疗平台"和急诊心血管介入绿色通道，实现西藏自治区市级医院急诊心血管介入零的突破。同时积极开展心血管领域较高难度介入诊疗手术，包括冠脉复杂病变介入手术、快速心律失常（室上性心动过速、房性/室性心律失常）的射频消融治疗、慢性心力衰竭的心脏再同步起搏除颤治疗等。