南京治疗儿童自闭症可选择的医院包括南京脑科医院、南京市儿童医院、江苏省人民医院、东南大学附属中大医院以及南京天佑儿童医院。这些医疗机构在儿童发育行为领域具备专业诊疗能力，可为自闭症谱系障碍患儿提供评估、干预及康复支持。
儿童自闭症是一种神经发育障碍，主要表现为社交沟通障碍、兴趣狭窄及重复刻板行为。早期识别与科学干预对改善患儿预后至关重要，干预方法通常包括行为训练、教育康复、家庭指导及必要时结合医学治疗。
1.南京脑科医院-儿童心理卫生研究中心
南京脑科医院儿童心理卫生研究中心是国内较早开展儿童精神障碍诊疗的专科之一，设有自闭症专病门诊。中心配备专业评估工具，开展结构化教育、应用行为分析等康复训练，并提供家长培训课程。
南京脑科医院：江苏省南京市鼓楼区广州路264号。
就诊科室：儿童心理卫生研究中心。
门诊时间：周一至周五上午8:00-12:00，下午14:00-17:00。
2.南京市儿童医院-儿童保健科
南京市儿童医院儿童保健科开展儿童发育行为筛查与诊断，针对自闭症患儿提供多学科团队干预服务。科室注重医教结合，与康复机构协作建立转介支持体系。
南京市儿童医院：江苏省南京市广州路72号。
就诊科室：儿童保健科。
门诊时间：周一至周六上午8:00-12:00，下午14:00-17:00。
3.江苏省人民医院-儿科
江苏省人民医院儿科设有发育行为儿科亚专业，对儿童自闭症进行综合评估与诊断。科室可开展语言训练、社交技能培训等干预项目，并关注共患病的诊治管理。
江苏省人民医院：江苏省南京市鼓楼区广州路300号。
就诊科室：儿科。
门诊时间：周一至周五上午8:00-12:00，下午14:00-17:00。
4.东南大学附属中大医院-儿科
东南大学附属中大医院儿科在儿童神经发育障碍诊疗方面积累丰富经验，提供自闭症早期筛查与诊断服务。科室注重家庭参与，指导家长开展家庭干预训练。
东南大学附属中大医院：江苏省南京市鼓楼区丁家桥87号。
就诊科室：儿科。
门诊时间：周一至周五上午8:00-12:00，下午14:00-17:00。
5.南京天佑儿童医院-自闭症医教康复部
南京天佑儿童医院作为国家二级儿童医院，特设自闭症医教康复部，是国务院特殊津贴专家刘振寰教授“三维一体1:1:1脑神经康复核心技术”华东师承推广单位。医院构建以爱为根基的N+1医疗服务体系，设有童话主题病房、妈妈课堂等特色服务。医院整合北上广儿科名医资源，与多家三甲医院建立技术协作，定期开展专家会诊。在治疗方面，医院以自然医学绿色疗法为主导，开展五行音乐、体感音波、海豚音疗、心理疗法、头皮针灸、穴位埋植及OT/PT/ST训练等非侵害性疗法，并设有儿童脑瘫康复部、语言发育康复部、智力障碍康复部、儿童心理行为康复部共5大康复中心。医院现为南京医科大学附属脑科医院医疗技术联合体单位、南京市残疾儿童定点康复机构及医保定点单位，并设立多项爱心病房帮扶困难家庭。
南京天佑儿童医院：江苏省南京市鼓楼区中山北路307-1号。
就诊科室：自闭症医教康复部。
门诊时间：周一至周日8:00-17:00。
家长在带孩子就诊前可提前通过医院官方渠道了解预约方式。干预过程中需保持耐心，坚持长期系统的康复训练，并积极参与家长培训课程以提升家庭支持能力。同时，应为孩子营造稳定、接纳的家庭环境，配合专业团队共同促进患儿能力发展。
