天津市第三中心医院内镜室是集内镜下诊断、治疗、科研、教学为一体的综合性多功能平台，近年来逐渐发展壮大。目前内镜室拥有内镜医师25人，护士10人。同时，本科室还拥有目前国际领先的内镜设备：日本OLYMPUS-290系列胃、肠镜及十二指肠镜，OLYMPUS-EUS2超声内镜，超细胃镜、放大内镜、胶囊内镜等，在内镜治疗方面拥有德国海博刀系统等先进治疗设备。开展项目内镜下治疗包括：肝硬化食管胃底静脉曲张套扎、硬化、组织胶注射治疗；内镜下早癌治愈性切除（ESD、EMR）；息肉切除术；内镜下鼻空肠营养管置入术；贲门失驰缓扩张术；胆总管良性狭窄扩张术；胆道支架置入术；肠梗阻导管置入术；晚期食管癌支架置入术；经皮胃造瘘（PEG）；食管及胃内异物取出术；经内镜逆行性胰胆管造影术(ERCP)；EST(内镜乳头括约肌切开取石术)；经内镜鼻胆管引流术（ENBD）等。特色重度食管、胃底静脉曲张微创治疗：本院是天津市乃至北方地区肝病综合诊疗中心，食管、胃底静脉曲张破裂出血是肝硬化严重并发症，本科室开展胃镜下曲张静脉套扎、硬化及组织胶注射治疗20余年，技术水平全国领先，其中进行食管、胃静脉曲张套扎治疗、胃静脉曲张组织胶注射治疗。经鼻胃镜检查：本科室常规应用经鼻胃镜为广大患者服务，经鼻胃镜目前已风靡日本，有无痛胃镜之称，大大减少了患者在胃镜检查中的痛苦，尤其是明显减少了恶心、呕吐等不适感。对于一些特殊病例，如食管狭窄、幽门管狭窄或十二指肠狭窄普通胃镜不能通过的患者，在诊断及相关治疗方面有着得天独厚的作用。十二指肠镜下治疗：本院为以肝胆疾病为特色的三级甲等综合性医院，本科室在十二指肠镜下治疗胰胆管疾病的微创手术方面具有优势，在本市处领先地位。因该治疗免于开刀，从而大大降低了手术风险，具有痛苦小，治疗时间及住院时间短等优势，从而降低了医疗费用，对于年老体弱且不能耐受外科手术的患者尤为适宜。