在吉林选择治疗近视眼的医院，可考虑吉林市中心医院眼科、北华大学附属医院眼科、吉林省中西医结合医院眼科、吉林大学第二医院眼科、长春中医药大学附属医院眼科等。
1. 吉林市中心医院眼科：这是吉林省成立较早的大型综合性公立三甲医院。其眼科是重要临床科室，能开展教学、科研、临床等多项工作。科室设备齐全，部分从国外采购，环境宽敞卫生，医护操作规范，可开展近视眼矫正、青光眼、白内障等项目。
2. 北华大学附属医院眼科：建院已有60多年历史，位于吉林市解放中路，周边交通便利。眼科规模较大，有门诊和病区，提供无菌化手术室、检查室、一对一诊室等。医生素质高、能力强，尊重患者需求，术前会安排详细检查，擅长近视眼角、青光眼手术、斜视、弱视等诊疗项目。
3. 吉林省中西医结合医院眼科：眼科是该院特色临床科室，坚持中西医结合的诊疗方法。科室内有多名经验丰富的医生和专家，能完成多台近视眼矫正手术，可做到个性化方案定制。
4. 吉林大学第二医院眼科：创于1936年，是国内知名的眼科中心。科室人才济济，有许多知名眼科专家，多年来积累了良好的口碑，一直受到广大患者的好评。
5. 长春中医药大学附属医院眼科：是吉林省中医药重点学科，基础设施配置精良，手术设备齐全，注重仪器消毒杀菌。该科室采用中西医结合治疗眼部疾病，将传统中医如针灸等与现代仪器激光等相结合，治疗效果较好。
总之，吉林有多家医院的眼科在近视眼治疗方面各有优势。患者可根据医院的地理位置、医疗技术、诊疗方法以及自身的实际需求等因素综合考虑，选择适合自己的医院进行治疗。