南通有不少治疗眼科较好的医院，如南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市中医院、南通市第三人民医院、南通爱尔眼科医院等。
1. 南通大学附属医院：其眼科是江苏省医学重点学科，1996年成为硕士学位授权点，也是省内白内障手术医师培训基地。拥有齐全的硬件设施，配备优质的眼科检查和诊疗设备，在白内障、青光眼、屈光不正等方面临床经验丰富，在飞秒激光矫正与晶体植入矫正方面病例多、经验丰富，医护人员会根据患者实际情况制定个性化方案，且收费公正合理。
2. 南通市第一人民医院：是集医疗、教学、科研于一体的国家三级甲等综合性医院。眼科作为南通医学重点专科，现有8名硕士学位者。开展常规的内障超声乳化手术、抗青光眼手术和眼部整形手术等，科室配备专业眼科设备，有严格消毒体系，近视眼矫正医生团队专业，手术操作规范，还提供多种矫正方式。
3. 南通市中医院：眼科拥有业务素质高且团结敬业的专业人才团队，现有三名高级职称人员。医院有一级临床和医技科室25个，二级临床科室13个，核定床位800张，能为患者提供较为全面的医疗服务。
4. 南通市第三人民医院：眼科创建于2001年，配备了眼科基本检查和诊疗设备，开展眼科常见病和多发病的诊疗。
5. 南通爱尔眼科医院：隶属于全球知名的眼科连锁机构，致力于为患者提供全方位的眼健康服务。拥有经验丰富的专业团队，可开展角膜移植、玻璃体切除等高难度手术，还实施了一系列规范化的质量管理措施以确保医疗安全和质量。
在南通选择治疗眼科的医院时，患者可以根据自身的眼部疾病情况、医院的特色和优势、距离远近等因素综合考虑。上述几家医院在眼科诊疗方面都有各自的特点和优势，能够为患者提供较为专业的眼科医疗服务。