南通有不少治疗近视眼较好的医院，南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市中医院、南通市第三人民医院、南通爱尔眼科医院等都各具优势。
1. 南通大学附属医院：其眼科是江苏省医学重点学科，医生毕业于名校，医疗技术扎实。医院开展了包括近视眼手术在内的各种特色眼科医疗手术，拥有近视眼手术专用的仪器设备和材料，能满足民众的手术需求。此外，该医院是三甲医保定点综合医院，在复旦全国眼科排名第69名。
2. 南通市第一人民医院：眼科是医院的重点专科，成立于1955年。这里有12名专科医生，其中4名是高级职称且拥有硕士学历，还有专业的护理人员。医院是集医疗、教学、科研于一体的国家三级甲等综合性医院，诊疗设施完善。
3. 南通市中医院：眼科拥有人才梯队结构合理的医师队伍，具有中医诊疗特色，可采用中医疗法解决角膜炎症、葡萄膜炎、眼底出血等问题，复发少。同时也能通过西医手段进行近视眼矫正，引进了美国的准分子激光仪器，操作更准确。
4. 南通市第三人民医院：眼科成立于2001年，可进行基本眼科检查，诊疗常见或复杂眼部疾病。坐诊医生多为主任医生以上级别，还会邀请专家坐诊。2004年购买进口泪道激光机，引进精良激光设备，可完成近视眼激光手术、人工晶体植入术等。
5. 南通爱尔眼科医院：成立于2017年，是爱尔眼科集团旗下分院。有不同的眼科医疗科室，能针对不同眼部疾病进行专业诊治。不断加强眼部技术实力提升，多次接受规范化技术训练，把握行业技术新动态，在近视眼手术方面有独特操作优势。
在南通选择治疗近视眼的医院时，患者可以根据自身需求、医院的优势以及距离远近等因素综合考虑。上述几家医院在近视眼治疗方面都有各自的长处，能为患者提供较为专业的医疗服务。