南通治疗眼科较好的医院有南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市中医院、南通爱尔眼科医院、启东市人民医院等。
1. 南通大学附属医院：其眼科是江苏省医学重点学科，1996年成为硕士学位授权点，也是省内白内障手术医师培训基地。医院拥有齐全的硬件设施，配备优质的眼科检查和诊疗设备，如眼科超声生物显微镜和多波长激光机等。在飞秒激光矫正与晶体植入矫正方面经验丰富，医护人员会根据患者近视眼实际情况制定个性化方案，且收费公正合理。
2. 南通市第一人民医院：这是一所集医疗、教学、科研于一体的国家三级甲等综合性医院。眼科作为南通医学重点专科，现有8名硕士学位者。科室配备专业的眼科设备，有严格的消毒体系，近视眼矫正的医生团队专业，手术操作规范，还提供多种矫正方式供患者选择。
3. 南通市中医院：眼科拥有一支业务素质高且团结敬业的专业人才团队，现有三名高级职称人员。医院始有一级临床和医技科室25个，二级临床科室13个，核定床位800张，能为患者提供较为全面的医疗服务。
4. 南通爱尔眼科医院：隶属于全球知名的眼科连锁机构，致力于为患者提供全方位的眼健康服务。该医院拥有经验丰富的专业团队，可开展角膜移植、玻璃体切除等高难度手术，并且实施了一系列规范化的质量管理措施以确保医疗安全和质量。
5. 启东市人民医院：眼科科学的人才团队比较完善，引进新技术开展新项目，注重与外界交流学习，曾派医生到上海新华医院和上海眼耳鼻喉科医院深造。具备丰富的经验和优良的诊疗水平，承担眼病防治和防盲等工作任务，拥有全套进口的超声乳化设备和进口的眼科手术显微镜等。
总之，这些医院在眼科诊疗方面各有优势和特色，患者可以根据自身的实际情况，如病情、距离、费用等因素综合考虑，选择适合自己的医院就诊。