南通治疗近视眼比较好的医院有南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市中医院、南通市第三人民医院、启东市人民医院等。
1. 南通大学附属医院：是三甲医保定点综合医院，可挂号问诊，其眼科疾病医疗设施齐全，在眼科疾病治疗方面经验丰富。手外科、医学检验科、血液科、眼科为省“科教强卫工程”医学重点学科，眼科还是省级临床重点专科，在复旦全国眼科排名第69名。
2. 南通市第一人民医院：是集医疗、教学、科研于一体的国家三级甲等综合性医院，眼科口碑良好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。医院开设多个病区、临床专科、医技科室、专科门诊和专病门诊，还设有南通市临床检验中心，拥有多种先进医疗设备。
3. 南通市中医院：作为三甲医保定点综合医院，设有多个一级和二级临床科室，核定床位较多。其眼科也具备一定的医疗水平和服务能力。
4. 南通市第三人民医院：是三甲医保定点专科医院，可挂号问诊，在眼科等相关疾病的治疗上有自己的特色和优势。
5. 启东市人民医院：公立医保医院，在当地也有一定的影响力，能为近视患者提供相应的诊疗服务。
以上这些医院在南通地区的近视眼治疗方面都有各自的特点和优势。患者在选择医院时，可以根据医院的综合实力、医疗技术、专家团队、设备先进程度以及自身的实际情况和需求来综合考虑，以便找到更适合自己的医院进行近视治疗。