南通有不少在眼科治疗方面表现出色的医院，如南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市中医院、南通市第三人民医院、南通江河泽明眼科医院等。
1. 南通大学附属医院：其眼科是江苏省医学重点学科，1996 年成为硕士学位授权点，也是省内白内障手术医师培训基地。医院硬件设施齐全，配备优质的眼科检查和诊疗设备。设有白内障防治中心、眼科激光中心等，分多个亚专科。拥有省内规模较大的眼科研究所和专职科研队伍，在致盲性眼病的分子流行病学及综合防治研究方面优势明显。
2. 南通市第一人民医院：眼科是南通医学重点专科，现有 8 名硕士学位者。开展常规的内障超声乳化手术、抗青光眼手术和眼部整形手术等。建科 50 多年完成多个课题研究，几年来在省级杂志发表 140 余篇学术论文，每年开展光明工程活动。引进计算机非接触眼压计和超声乳化机辅助手术操作。
3. 南通市中医院：眼科拥有业务素质高且团结敬业的专业人才团队，现有三名高级职称人员。
4. 南通市第三人民医院：眼科创建于 2001 年，配备基本的检查和诊疗设备，开展眼科常见病和多发病诊治。门诊由主治医生以上医生坐诊，还常年邀请南通大学附属医院原眼科主任定期坐诊。2005 年开设白内障诊治专科，采用国际优质的白内障超声乳化技术。
5. 南通江河泽明眼科医院：是南通市儿童青少年近视防控基地、全飞秒手术官方认证医院、ICL 晶体植入手术官方认证医院。医院特聘多位资历深厚的医生定期坐诊。
以上这些医院在眼科领域各有特色和优势，患者可以根据自身的眼部疾病情况、医院的距离、专家资源等因素综合考虑，选择适合自己的医院就诊。