在南通，有不少治疗眼科疾病较好的医院，南通大学附属医院眼科、与南通医学院附属医院眼科有学术合作的阜宁县红十字施庄眼科医院、设立了江苏省连云港光明眼科医院的莒南光明眼科医院等都值得考虑。
1. 南通大学附属医院眼科：在江苏眼科医院排名较为靠前，该医院眼科诊疗水平较高，拥有专业的医疗团队，能够开展各种眼科诊疗项目，具备先进的医疗技术和齐全的硬件设施，服务态度也较为优良，是市临床重点专科。
2. 阜宁县红十字施庄眼科医院：虽然其位于阜宁，但与南通医学院附属医院眼科保持着广泛的学术合作。它是集眼病防治、科研为特色的民营专科医院，前身是苏北地区素有声望的刘氏眼科，受到国际CBM组织认可。多年来一直以人为本，聘请专家来院讲课并培养医生动手能力。
3. 莒南光明眼科医院：这所医院成立于2000年，是集眼病研究、保健、诊治为一体的现代化二级眼科医院。2012年为满足患者服务需求，设立了江苏省连云港光明眼科医院，现已发展成为苏北地区规模较大的眼科医院。该医院始终坚持“以病人为中心，以质量为核心”的服务理念，弘扬“人道、博爱、奉献”的红十字精神，在苏北及鲁东南地区享有一定声誉。
南通及周边地区有多家在眼科治疗方面表现出色的医院。患者可以根据自身的实际情况，如病情的复杂程度、距离医院的远近、医院的口碑等因素综合考虑，选择适合自己的医院进行眼科疾病的诊断和治疗。