南通有不少眼科实力较强的医院，南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市第三人民医院、南通市中医院、南通市妇幼保健院等都值得推荐。
1. 南通大学附属医院：是三甲医保定点综合医院，其眼科是江苏省医学重点学科，1996年成为硕士学位授权点，也是省内白内障手术医师培训基地。医院硬件设施齐全，有优质的眼科检查和诊疗设备，设立两个病区、50张床位，独立手术室可开展近视眼手术等多领域服务，在复旦全国眼科排名第69名。
2. 南通市第一人民医院：同样为三甲医保定点综合医院，其眼科是南通医学重点专科，现有8名硕士学位者。开展常规内障超声乳化手术、抗青光眼手术和眼部整形手术等，建科50多年完成多个课题研究，发表140余篇学术论文，每年开展光明工程活动。还引进计算机非接触眼压计和超声乳化机辅助手术操作。
3. 南通市第三人民医院：作为三甲医保定点专科医院，眼科创建于2001年，拥有基本的检查和诊疗设备，开展眼科常见病和多发病诊治。门诊由主治医生以上坐诊，还常年邀请南通大学附属医院原眼科主任定期坐诊。2005年开设白内障诊治专科，采用国际优质的白内障超声乳化技术。
4. 南通市中医院：三甲医保定点综合医院，其眼科拥有业务素质高且团结敬业的专业人才团队，现有三名高级职称人员。
5. 南通市妇幼保健院：三甲医保定点专科医院，眼科设立了儿童眼保健门诊，承担区域内儿童眼部保健和医疗工作，年门诊量万余人次。可开展儿童眼保健宣传防治工作，斥巨资配备视力筛查仪、弱视诊疗机以及同视机等设备，方便儿童就诊，还在省级以上杂志发表10篇医学论文。
在南通选择眼科医院时，可根据自身需求和实际情况进行综合考虑。若追求综合实力和科研教学水平，南通大学附属医院是不错的选择;若看重眼科专科特色和丰富临床经验，南通市第一人民医院和第三人民医院值得考虑;关注中医特色治疗可选择南通市中医院;而有儿童眼科相关需求，南通市妇幼保健院会更合适。