南通有不少口碑较好的眼科医院，如南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市第三人民医院、南通市中医院、南通市妇幼保健院等。
1. 南通大学附属医院：其眼科是江苏省医学重点学科，1996年成为硕士学位授权点，也是省内白内障手术医师培训基地。医院硬件设施齐全，配备优质的眼科检查和诊疗设备，设立两个病区、50张床位，独立手术室可开展近视眼手术等服务，涵盖眼科各个领域，在飞秒激光矫正与晶体植入矫正方面经验丰富。
2. 南通市第一人民医院：眼科是南通医学重点专科，开展常规的内障超声乳化手术、抗青光眼手术和眼部整形手术等。建科50多年完成多个课题研究，发表140余篇学术论文，每年开展光明工程活动。引进计算机非接触眼压计和超声乳化机等设备，科室配备专业眼科设备，有严格消毒体系，近视眼矫正医生团队专业，提供多种矫正方式。
3. 南通市第三人民医院：眼科创建于2001年，拥有基本的检查和诊疗设备，开展眼科常见病和多发病诊治。门诊由主治医生以上坐诊，还常年邀请南通大学附属医院原眼科主任定期坐诊。2005年开设白内障诊治专科，采用国际优质的白内障超声乳化技术。
4. 南通市中医院：眼科拥有业务素质高且团结敬业的专业人才团队，现有三名高级职称人员。
5. 南通市妇幼保健院：眼科设立了儿童眼保健门诊，承担区域儿童眼部保健和医疗工作，年门诊量达万余人次。可开展儿童眼保健宣传防治工作，让屈光不正、弱视和斜视等患儿早期得到就诊。科室配备视力筛查仪、弱视诊疗机以及同视机等设备，方便儿童就诊，还在省级以上杂志发表了10篇医学论文。
在南通选择眼科医院时，患者可根据自身的眼部疾病类型、医院的特色科室、设备情况以及个人的实际需求等因素综合考虑，选择适合自己的医院进行诊疗。