南通有不少专业治疗眼科的医院，如南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市中医院、南通瑞慈医院、南通爱尔眼科医院等。
1. 南通大学附属医院：是三甲医保定点综合医院，可挂号问诊。其眼科在复旦全国眼科排名第69名，手外科、医学检验科、血液科、眼科为省“科教强卫工程”医学重点学科，眼科还是省级临床重点专科。
2. 南通市第一人民医院：为三甲医保定点综合医院，集医疗、教学、科研于一体。开设众多病区、临床专科、医技科室、专科门诊和专病门诊，南通市临床检验中心也设在此院，拥有多种先进医疗设备。
3. 南通市中医院：作为三甲医保定点综合医院，有一级临床和医技科室25个，二级临床科室13个。医院职工众多，有不少具有高级职称者和硕博士。
4. 南通瑞慈医院：其眼科是集检查、诊治、手术、保健、科研为一体的专科科室，拥有先进技术和一流设备。有多名眼科医生，能开展多种眼科手术，治疗多种复杂眼底病变及常见眼科疾病。
5. 南通爱尔眼科医院：提供高度近视、假性近视、高度近视矫正等服务，专注于各类屈光不正、白内障、青光眼等眼科疾病的诊断和治疗。
这些医院在眼科治疗方面各有优势，患者可以根据自身的实际情况，如病情的复杂程度、距离远近、个人经济状况等，选择适合自己的医院就诊，以获得专业有效的眼科治疗。