南通有不少眼科诊疗水平较高的医院，如南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市中医院、南通市第三人民医院、南通爱尔眼科医院等。
1. 南通大学附属医院：是三甲医保定点综合医院，其眼科是江苏省医学重点学科，1996 年成为硕士学位授权点，也是省内白内障手术医师培训基地。医院硬件设施齐全，配备优质的眼科检查和诊疗设备，设有两个病区、50 张床位，独立手术室可开展近视眼手术等服务，涵盖眼科各个领域。在飞秒激光矫正与晶体植入矫正方面积累了大量病例，医护人员会根据患者实际情况制定个性化方案。
2. 南通市第一人民医院：作为三甲医保定点综合医院，其眼科是南通医学重点专科，现有 8 名硕士学位者。开展常规的内障超声乳化手术、抗青光眼手术和眼部整形手术等，建科 50 多年完成多个课题研究，在省级杂志发表 140 余篇学术论文，每年开展光明工程活动。配备计算机非接触眼压计和超声乳化机等设备，科室有严格的消毒体系，医生团队专业，手术操作规范，提供多种矫正方式。
3. 南通市中医院：为三甲医保定点综合医院，眼科拥有业务素质高且团结敬业的专业人才团队，现有三名高级职称人员。医院始有一级临床和医技科室 25 个，二级临床科室 13 个，核定床位 800 张，能为患者提供较为全面的医疗服务。
4. 南通市第三人民医院：属于三甲医保定点专科医院，眼科创建于 2001 年，配备基本的检查和诊疗设备，开展眼科常见病和多发病诊治，门诊由主治医生以上坐诊，还常年邀请南通大学附属医院原眼科主任定期坐诊。2005 年开设白内障诊治专科，采用国际优质的白内障超声乳化技术，手术数分钟即可完成晶体乳化人工晶体植入。
5. 南通爱尔眼科医院：在当地也有较高的口碑，医院专注于眼科领域，有着专业的医疗团队和先进的诊疗技术，能为患者提供全面的眼科检查和个性化的治疗方案。
以上几家医院在眼科诊疗方面都各有优势，患者可以根据自身的实际情况，如病情、距离远近、医院特色等因素，选择适合自己的医院就诊。