南通有不少眼科较好的医院，如南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市第三人民医院、南通市中医院、南通市妇幼保健院等。
1. 南通大学附属医院：是三甲医保定点综合医院，其眼科是江苏省医学重点学科，1996年成为硕士学位授权点，也是省内白内障手术医师培训基地。拥有齐全的硬件设施，配备优质的眼科检查和诊疗设备，设立两个病区、50张床位，独立手术室可同时开展近视眼手术等医疗服务，涵盖眼科各个领域，在复旦全国眼科排名第69名。
2. 南通市第一人民医院：为三甲医保定点综合医院，其眼科开展常规的内障超声乳化手术、抗青光眼手术和眼部整形手术等。建科50多年完成多个课题研究，几年来在省级杂志发表140余篇学术论文，每年开展光明工程活动。引进计算机非接触眼压计和超声乳化机，为手术操作提供辅助。该科室是南通医学重点专科，现有8名硕士学位者。
3. 南通市第三人民医院：作为三甲医保定点专科医院，其眼科创建于2001年，拥有基本的检查和诊疗设备，开展眼科常见病和多发病诊治。门诊由主治医生以上医生坐诊，还常年邀请南通大学附属医院原眼科主任定期坐诊。2005年开设白内障诊治专科，采用国际优质的白内障超声乳化技术，数分钟即可完成晶体乳化人工晶体植入。
4. 南通市中医院：属于三甲医保定点综合医院，其眼科拥有业务素质高且团结敬业的专业人才团队，现有三名高级职称人员。
5. 南通市妇幼保健院：是三甲医保定点专科医院，其眼科设立了儿童眼保健门诊，承担区域内儿童眼部保健和医疗工作，年门诊量达万余人次。可开展儿童眼保健宣传防治工作，让很多屈光不正、弱视和斜视等患儿早期得到就诊。科室配备了视力筛查仪、弱视诊疗机以及同视机等设备，方便儿童就诊，创建以来在省级以上杂志发表了10篇医学论文。
南通这些医院的眼科在医疗技术、设备、人才等方面各有优势，患者可以根据自身的眼部疾病类型、需求以及医院的距离等因素综合考虑，选择适合自己的医院就诊。