南通有不少可以治疗眼科疾病的医院，例如南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市中医院、南通市第三人民医院、南通江河泽明眼科医院等。
1. 南通大学附属医院：其眼科是江苏省医学重点学科，也是省准分子激光角膜屈光手术及白内障超声乳化技术培训基地。专科设立齐全，设有白内障防治中心、眼科激光中心等，分多个亚专科。拥有省内规模较大的眼科研究所和专职科研队伍，在致盲性眼病的分子流行病学及综合防治研究方面优势明显。
2. 南通市第一人民医院：这是一所集医疗、教学、科研于一体的国家三级甲等综合性医院。眼科开展常规的内障超声乳化手术、抗青光眼手术和眼部整形手术等。建科50多年来完成多个课题研究，发表140余篇学术论文，每年开展光明工程活动。还引进了计算机非接触眼压计和超声乳化机等设备。
3. 南通市中医院：有一级临床和医技科室25个，二级临床科室13个。医院职工专业素质较高，具有高级职称者和硕博士众多，其眼科也能为患者提供专业的诊疗服务。
4. 南通市第三人民医院：眼科拥有基本的检查和诊疗设备，开展眼科常见病和多发病诊治。门诊由主治医生以上的医生坐诊，还常年邀请南通大学附属医院原眼科主任定期坐诊。2005年开设白内障诊治专科，采用国际优质的白内障超声乳化技术。
5. 南通江河泽明眼科医院：是南通市儿童青少年近视防控基地、全飞秒手术官方认证医院、ICL晶体植入手术官方认证医院。医院医生技术较好，特聘多位资历深厚的医生定期坐诊。
总之，南通的这些医院在眼科疾病的治疗方面各有优势和特色。患者可以根据自身的实际情况，如病情、距离等，选择合适的医院就诊。