南通有不少眼科诊疗水平较高的医院，南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市中医院、南通市第三人民医院、南通爱尔眼科医院等都是不错的选择。
1. 南通大学附属医院：其眼科是江苏省医学重点学科，1996年成为硕士学位授权点，也是省内白内障手术医师培训基地。医院硬件设施齐全，配备优质的眼科检查和诊疗设备。设立两个病区、50张床位，独立手术室可开展近视眼手术等服务，涵盖眼科各个领域，在飞秒激光矫正与晶体植入矫正方面经验丰富。
2. 南通市第一人民医院：眼科是南通医学重点专科，现有8名硕士学位者。开展常规的内障超声乳化手术、抗青光眼手术和眼部整形手术等。建科50多年完成多个课题研究，发表140余篇学术论文，每年开展光明工程活动。引进计算机非接触眼压计和超声乳化机，为手术操作提供辅助，且科室有严格消毒体系，降低交叉感染风险。
3. 南通市中医院：眼科拥有业务素质高且团结敬业的专业人才团队，现有三名高级职称人员。医院有一级临床和医技科室25个，二级临床科室13个，核定床位800张，能为患者提供较为全面的医疗服务。
4. 南通市第三人民医院：眼科创建于2001年，配备基本的检查和诊疗设备，开展眼科常见病和多发病诊疗。门诊由主治医生以上的医生坐诊，还常年邀请南通大学附属医院原眼科主任定期坐诊。2005年开设白内障诊治专科，采用国际优质的白内障超声乳化技术。
5. 南通爱尔眼科医院：在南通地区口碑较好，能为患者提供专业的眼科诊疗服务，在眼科疾病的诊断和治疗方面有一定优势。
总之，上述几家医院在眼科领域各有优势和特色。患者可以根据自身的实际情况，如病情、交通便利性等，选择适合自己的医院就诊。如果是疑难复杂的眼科疾病，南通大学附属医院等综合实力较强的医院可能是更好的选择;如果是常见眼科疾病，其他几家医院也能提供优质的诊疗服务。