在南通治疗眼科疾病，南通大学附属医院眼科、连云港光明医院、阜宁县红十字施庄眼科医院等都是不错的选择。这些医院在医疗技术、设备、专家资源、服务质量以及口碑等方面各有优势。
1. 南通大学附属医院眼科：在江苏眼科医院排名较为靠前，是苏北地区医疗技术先进、硬件设施齐全、服务态度优良的知名眼科中心，也是市临床重点专科，能开展各种眼科诊疗项目。
2. 连云港光明医院：是经市卫生局引进批准设立的具有专科特色的二级医院，属非营利性医疗机构。医院配有世界尖端的设备，可开展高端、微创、复杂的手术，特别是飞秒激光治疗白内障、近视等方面与国际同步，在微创玻璃体视网膜手术方面具有独到之处。医院还凝聚了一批高端人才，长期与国外眼科同仁进行学术互访，定期聘请国内外专家来院讲学和指导手术。
3. 阜宁县红十字施庄眼科医院：是集眼病防治、科研为特色的民营专科医院，其前身是苏北地区素有声望的刘氏眼科。多年来一直信奉以人为本，聘请专家常年来院讲课及培养上台动手能力，并与南通医学院附属医院眼科保持着广泛的学术合作。
总之，这些医院在眼科治疗领域都有各自的特色和优势。患者可以根据自身的实际情况，如病情的复杂程度、距离医院的远近等，综合考虑选择适合自己的医院进行眼科治疗。