南通有不少治疗近视眼效果较好的医院，比如南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市中医院、南通市第三人民医院、南通市第二人民医院等。
1. 南通大学附属医院：眼科疾病医疗设施齐全，配备全飞秒、激光矫正设施等先进设备。拥有多名副主任医师、主治医师和住院医师，还有专业医护人员，科室规模较大。其手外科、医学检验科、血液科、眼科为省“科教强卫工程”医学重点学科，在眼科疾病治疗方面经验丰富。
2. 南通市第一人民医院：眼科科室于1955年成立，有12名专科医生，其中4名是高级职称且拥有硕士学历，还有专业护理人员。该医院是集医疗、教学、科研于一体的国家三级甲等综合性医院，眼科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
3. 南通市中医院：眼科具有中医诊疗特色，可采用中医疗法解决角膜炎症、葡萄膜炎、眼底出血等问题，复发少。也能通过西医手段进行近视眼矫正，近年引进美国准分子激光仪器，有助于更准确操作。
4. 南通市第三人民医院：眼科成立于2001年，能进行基本眼科检查，诊疗常见或复杂眼部疾病。坐诊医生大多是主任医生以上级别，还常邀请专家坐诊。2004年购买进口泪道激光机，引进精良激光设备，可完成近视眼激光手术、人工晶体植入术等。
5. 南通市第二人民医院：环境幽雅舒适，设有眼科等多个临床医技科室，开展准分子矫治近视、远视、散光、白内障手术、儿童近视、斜视及弱视力矫正的综合治疗。凝聚了一批有影响力的眼科医生，有丰富临床经验和科研学术积淀。
以上这些医院在近视眼治疗方面各有优势，患者可以根据自身的实际情况，如距离远近、病情需求、治疗偏好等，选择适合自己的医院就诊。