呼吸内科（呼吸与危重症医学科）是国家临床重点专科、国家呼吸与危重症医学（PCCM）专科医师培训基地、国家临床药品试验基地、国家呼吸区域中心-委省共建牵头单位（创建）、重庆市重点学科、重庆市"呼吸危重症医学研究中心"、中华医学会呼吸分会全国委员单位、重庆市首批医学领军人才单位、博士学位授予点、博士后流动站。两院区共床位200张，RICU床位20张，呼吸介入中心500平方米；医生队伍有博士学位达80%，教授8名，副教授10名；有国务院特殊津贴专家2名，二级教授1名，重庆市学术带头人1名，重庆市学术带头人后备人才1名，重庆市中青年医学高端人才3名。在重症肺炎、急性呼吸窘迫综合症等呼吸危重症救治达到国内先进水平；在肺癌、肺结核、等微创介入技术达国内先进水平；超声气管镜（EBUS）诊治极具优势；慢阻肺哮喘等肺康复经验丰富，是重庆市肺小结节与肺癌工作室授予单位。技术实力及服务质量名列西南地区前茅。