2003年西南医院乳腺组从普通外科分离，正式成立独立的乳腺外科。经十年的发展，被中华全国妇女联合会中国妇女发展基金会和中华医学会肿瘤学分会授予"乳腺疾病诊疗中心暨培训基地"，2005年被总参谋部正式定编为全军唯一的"乳腺外科"，2007年被国家教育部批准为国家重点学科，2008年被批准为全军专科中心。系硕士、博士授权学科和博士后流动站。2012年当选为中华医学会乳腺癌学组组长单位。西南医院乳腺外科是国内综合医院规模最大的乳腺、甲状腺疾病专科中心之一。担负乳腺、甲状腺疾病临床医疗、教学、科研和预防保健等任务。现有各类人员100余名，展开床位120张。拥有专科病房、专科门诊、专家门诊、专科手术室、门诊治疗室、活检手术室、乳管镜室、专科护理、护理专家门诊、康复护理、实验室、临床研究室、数据中心等功能单元。具有国际领先的医疗设施和齐全的诊疗设备。年门诊量9万余人次、手术量6千余人次。提出创新的乳腺疾病精准诊疗理论体系；创建了"乳腺疾病系列腔镜手术治疗技术"、"自体淋巴组织移植治疗乳腺癌上肢水肿"、"成分血液分离技术用于乳腺癌循环肿瘤细胞检测"等核心技术。形成了十余项临床优势特色技术。解决了多项临床技术难题，临床治疗效果国内领先。获军队医疗成果一、二、三等奖各1项、重庆市科技进步一等奖1项、"十一五"军队医学科技重大成果奖1项、获得中华医学科技奖一等奖1项。培养博士后、博士、硕士研究生70余名。科室10余位医护人员先后100余次应邀在国内外会议做大会特邀报告。