为加快学科发展，2016年10月医院整合心血管内科和心脏大血管外科，成立心脏中心，通过院内多学科联动，并整合院外医疗资源，建立起区域协同快速救治体系，提高库区整体救治水平。目前，该中心是国家药物临床试验机构(心血管专业)、国家心脏中心心血管技术协作中心、中国基层医师心血管疾病培训示范中心、中国胸痛中心授牌（标准版）、重庆心律失常联盟副理事长单位、重庆市区域重点学科、心脏康复中心建设单位、是重庆市儿童先天性心脏病定点治疗救助单位之一。设心血管内科病区和心脏大血管外科病区，并有小儿心脏、心脏电生理、心脏超声优势资源，为重症心脏、大血管疾病患者保驾护航。该中心拥有独立的心导管室、心脏电生理室、药物临床试验办公室。配有数字减影血管造影系统、射频消融仪、主动脉泵、心衰超滤泵、心肺运动检查仪、气囊式体外反搏、电生理分析仪、ECMO、IABP、CRRT、Picco、有创呼吸机、无创呼吸机、Airvo高流量吸氧仪、心电监护仪、小儿心脏起搏器、体外循环机等高精尖设备。心血管内科病区主要收治冠心病、心绞痛、急性心肌梗死、高血压、心力衰竭、心律失常、风湿性心脏瓣膜病、心肌炎、心肌病、先天性心脏病、主动脉夹层、血脂紊乱、外周血管疾病等各类心血管疾病患者。开展项目有冠状动脉造影术、动脉造影术、冠状动脉介入治疗术、急诊PCI，心律失常心内电生理检查及射频消融术，心脏起搏器植入术（包括ICD、CRT），动脉导管未闭、房间隔缺损、室间隔缺损及卵圆孔未闭介入封堵术，肾动脉消融治疗顽固性高血压，下腔静脉滤网植入术，主动脉内气囊反搏术，经皮肾动脉腔内成形加支架植入术，经皮二尖瓣、肺动脉瓣球囊成形术，主动脉覆膜支架植入术、肥厚型梗阻性心肌病室间隔化学消融术，瓦氏窦破裂封堵术、聚多卡醇泡沫硬化剂-治疗下肢静脉曲张术、右心导管检查术等。心脏大血管外科病区主要诊治先天性心脏病、心脏瓣膜病、主动脉疾病、冠状动脉、颈动脉疾病、心房颤动、心包及心脏肿瘤的外科治疗等，专业化的监护团队能进行ECMO、IABP、床旁CRRT、呼吸机治疗、高流量氧治疗、亚低温治疗、血浆置换等高精尖监护治疗。