呼吸内科于1989年成立，2008年3月独立建科，位于内科楼8楼、7楼（二病区），包括普通病房、呼吸危重监护室（RICU）、呼吸实验室（肺功能、电子气管镜）、呼吸疾病研究所，是重庆市区域性重点学科，重庆市重点特色专科，重庆市临床重点专科，江津区重点专科，本院重点专科。共设床位142张，其中普通床位132张，重症监护（RICU）床位10张。2018年收治病人超过5000人次。科室共有医生13名，其中主任医师1名，副主任医师2名，主治医师6名，医师4名；其中硕士研究生6名。护士共25名，其中本科学历7名，大专学历18名，其中主管护师4名。人员均在四川大学华西医院、重庆医科大学附属第一医院、重庆医科大学附属第二医院、第三军医大学新桥医院等各大医院进修学习。2004年与北京呼吸疾病研究所建立了业务合作关系，承担着重庆医科大学、泸州医学院、重庆医学高等专科学校、三峡医学高等专科学校等医学院校医疗、护理本专科学生带教任务。本科室除在呼吸系统常见病、多发病诊治上有丰富的经验，在呼吸危重症的救治、肺癌早期诊断及晚期肺癌的介入治疗、胸腔积液的诊断和综合治疗等方面形成了鲜明的特色。科室已有呼吸危重症亚组、气管镜介入亚组、经支气管动脉介入亚组。自2009年起，本科室每年都有自己的科研成果、临床经验等在重庆市级专委会（呼吸专委会、结核病专委会、中西医结合呼吸专委会等）学术会议上做大会交流2-3次。呼吸科拥有先进的设备：肺功能室有耶格大型肺功能检查仪1台、Vitalograph便携性肺功能检测仪1台；气管镜室有OlympusBP-260电子气管镜1台、治疗镜1台，OlympusBP-XT30纤维支气管镜2台；德国Drager呼吸机1台，Raphael呼吸机1台，伟康Vision无创呼吸机6台、小型无创呼吸机5台、OsmetechOPTI血气分析仪1台；心电监护仪20台；爱尔博氩等离子体凝固设备1台、爱尔博冷冻设备1台。近5年来在《癌症》、《四川大学学报医学版》、《第三军医大学学报》、《实用内科杂志》、《临床肺科杂志》、《重庆医学》、《实用医学护理杂志》、《中华护理杂志》》、《中华临床医师杂志》（电子版）等刊物发表文章70多篇。参与了全国多中心哮喘状况研究及全国慢阻肺控制现状调查研究等多个国家级课题，与重庆医科大学、第三军医大学各附属医院呼吸科均有密切联系。承担重庆市卫生局课题2项(2009，2010)，江津区科委课题4项(2010，2011)，重庆市自然科学基金面上项目1项(2011)；获实用新型专利2项（2012,2013）；是重庆市内同级医院承担科研课题数量最多、级别最高的科室之一。科室3人为6个省级专业委员会委员；牟江、万礼、桂天绪、雷仕鹏、黎晓强等多位医师先后在教学讲课、渝西片区呼吸沙龙演讲比赛等多次获奖；科室医护人员先后获得"江津区十佳医生"、"重庆市卫生系统优秀党员"、"江津区卫生系统优秀党员"、"江津区卫生系统十佳医生"、"江津区中心医院十佳护士长"等荣誉；科室连续8年被医院评为先进科室。