小儿外科成立于1988年，现有床位48张，拥有一批技术力量雄厚、德才兼备的人才队伍和先进的仪器设备，开设了小儿普外、新生儿外科、小儿骨科、小儿泌尿外科、小儿神经外科、小儿胸外等专业组，拥有主任医师2名、副主任医师3名、硕士研究生8名。近十年来，该科充分吸收国内外的先进技术，博采众长，使得业务水平飞速发展。在小儿先天性畸形矫正手术如食管闭锁-气管食管瘘、食道裂孔疝、先天性膈疝、先天性高位无肛腹会阴及骶会阴肛门成形术、小儿先天性肠旋转不良Ladd’s手术、环状胰腺的菱形吻合术、小儿先天性马蹄内翻足及先天性髋关节脱位的矫正、先天性肠闭锁纠治手术、先天性肾积水肾盂输尿管成形术、肾输尿管结石、输尿管囊肿、输尿管异位开口及小儿各种良恶性肿瘤的治疗达到了国内先进水平。运用小儿内镜技术诊治小儿外科疾病，如先天性巨结肠根治术、小儿胆总管囊肿Roux-Y吻合术、膈疝修补术、膈膨升膈肌折叠术，肺叶切除术，胆囊切除术、疝修补术、阑尾切除术、畸胎瘤切除术、幽门环肌切开术、肛门成形术、先天性十二指肠梗阻矫治术及肾盂成形术等已达国内先进水平。小儿外科每年收治2000余例患者、开展1600余例手术，其中小儿腹腔镜手术近千余例。由于创伤小、预后好、危险低、术后不留疤痕，受到了患者的一致好评。