造血干细胞移植科是集医疗、科研、教学一体的综合性血液科，成立于1986年，是目前全军唯一的造血干细胞移植中心和全军造血干细胞研究所，是全军博士、硕士学位授予单位，设有博士后流动站。研究所拥有4个病区和一个中心实验室（包括GMP认证的实验室），其中移植层流病房24间。造血干细胞移植科是国内最早开展骨髓移植的单位，也是国内规模较大的造血干细胞移植中心，每年完成各类造血干细胞移植300余例，是中华骨髓库定点移植中心和干细胞采集中心，中心特色为造血干细胞移植和肿瘤细胞免疫治疗，包括各类白血病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤、骨髓增生异常综合征等骨髓增殖性疾病、骨髓衰竭性疾病和出凝血疾病的移植。中心实验室建立了国际先进、国内领先的高水平血液系统疾病的规范化诊断平台，包括骨髓形态学、流式细胞学、细胞遗传学、基因检测等，并在此基础上搭建高效产出的转化医学平台。科室先后承担了国家"863"高技术研究计划、国家"十一五"重点和"十二五"重点、国家新药创制重大专项攻关计划、国家自然科学基金项目、军队重点项目等多项国家和省部级课题。2014年获国家科技进步一等奖（第一完成单位），先后获国家科技进步三等奖1项、军队科技进步一等奖1项、军队科技进步二等奖1项和军队医疗成果二等奖2项。