第五医学中心南院区眼科以临床常见病的诊治为主，临床经验丰富，医疗设备先进。聘请解放军总医院第一医学中心眼科黄一飞教授为我院眼科客座教授，定期邀请国内知名专家到我院眼科指导诊疗、教学工作。眼科发表SCI论文5篇，授权美国发明专利1项，国家发明专利2项。获得国家自然科学基金青年项目和博士后面上项目各1项。我中心眼科拥有国际先进的医疗设备和检查仪器：日本拓普康OMS-800手术显微镜、3D-OCT-1000MARKⅡ光学相干断层扫描仪、CANANTXF非接触眼压计、KR-8900电脑角膜验光仪、NSP-9900角膜内皮仪、美国爱尔康INFINITI超声乳化仪、法国光太眼前节治疗仪、眼A/B超声诊断仪、综合验光台及VT-10视力检查器、角膜地形图、视野计、同视机、弱视治疗仪等国内外先进设备和仪器，以诊断、治疗眼科常见病、多发病、急症及部分疑难病症为主，如白内障、青光眼、视网膜病变、眼眶肿瘤、眼部外伤、屈光不正等疾病的诊疗工作；同时还承担北京地区及全军放射从业人员、辐射事故所致的眼部损伤及各种化学中毒所致的眼部损伤，眼科职业病的诊断治疗工作；在驻京部队眼科率先成立眼视光诊疗特色项目；开展视网膜变性疾病干细胞治疗的临床转换研究等。