支原体感染的危害程度因感染部位、病原体种类、治疗是否及时规范以及个体免疫力差异而有所不同，但总体上不容忽视，需要引起足够重视。及时诊断、规范治疗可有效控制危害，患者应积极就医，在医生指导下完成全程治疗，避免病情迁延导致严重后果。
1、支原体感染的危害主要取决于多种因素的综合作用。解脲支原体和人型支原体主要侵犯泌尿生殖系统，引起局部炎症反应。若不及时治疗，感染可沿生殖道上行扩散至前列腺、附睾、输卵管等部位，引起慢性炎症。慢性炎症长期存在可导致组织纤维化、管腔狭窄或阻塞，进而影响生殖器官的正常功能，严重者可导致不可逆的损伤和生育障碍。
2、主要危害包括：男性患者可发生非淋菌性尿道炎、慢性前列腺炎、附睾炎、精囊炎，炎症长期存在可影响精子活力、形态和数量，严重者可导致男性不育；女性患者可引起宫颈炎、子宫内膜炎、盆腔炎、输卵管炎，输卵管受损后增加不孕症和异位妊娠的发生风险。孕妇感染支原体可导致流产、早产、胎膜早破等不良妊娠结局。
3、治疗可遵医嘱使用阿奇霉素、多西环素、左氧氟沙星、莫西沙星等对支原体敏感的抗生素。有并发症者通常需要延长疗程至2至4周。不孕不育相关问题需转诊至生殖医学专科进一步诊治。药物治疗必须足量足疗程，即使症状好转也不可自行停药，以免产生耐药性和疾病复发。
4、日常护理应注意个人卫生，每日清洗外阴保持清洁干燥。多饮水促进排尿冲刷尿道。避免饮酒和辛辣刺激食物。治疗期间禁止性生活。配偶或性伴侣应同时检查治疗。穿宽松透气内裤。保持乐观心态，积极配合治疗。遵医嘱定期复查。
5、预防方面应洁身自好，避免不洁性行为。正确使用安全套。定期体检筛查。感染者应及时告知性伴侣共同检查治疗。治愈后复查确认病原体清除。加强性健康教育，提高自我保护意识。注意增强免疫力，避免过度疲劳和长期精神紧张。
日常护理建议以及时规范治疗为重点。若出现持续发热、剧烈疼痛、阴囊肿胀、关节肿痛等危险信号，应立即就医。所有治疗必须在医生指导下规范完成。