呼吸内科（肺病科）为江苏省中医重点专科，具有较为深厚的吴门医派学术基础和传统中医特色，在充分运用吴门医派温病学说治疗各类急慢性呼吸系统疾病，如慢性不明原因咳嗽、慢性阻塞性肺病、支气管哮喘、肺间质疾病和中晚期肺癌方面，具有显著的特色和优势。拥有羌菊感冒冲剂、抗病毒颗粒、止嗽合剂、参蛤散、扶正胶囊等专科特色中药制剂，开设冬病夏治"穴位敷贴"门诊、"冬令调补"中药膏方门诊，深受慢性呼吸疾病患者欢迎。专科目前为南京中医药大学硕士研究生培养点，拥有何焕荣全国名老中医药专家传承工作室，近年来承担或合作承担了省部级及市级科研项目6项，先后获省、市科技进步奖4项。