肛肠外科是以中医痔瘘疾病为主要诊疗范围的临床专科，涵盖痔疮，肛瘘，直肠脱垂，脱肛，便秘，肛门狭窄，大肠炎性病和肛周皮肤病等。科室聘用南京全国肛肠中心叶辉副教授，副主任医师为学科带头人，直接为科室注入省级医疗水平和先进技术。专科注重中西医结合，在保留中医特色，成功开展常见疾病手术的同时。开展的"肛门脓肿一次切开根治术"，成功解决了术后成瘘和再次手术的需要，采用"高位复杂肛瘘切开旷置术"，"环状混合痔分段齿形结扎术"，"环状混合痔切除保留皮瓣缝合术"，"肛门狭窄切开挂线术"等领先技术均成功解决了肛肠科疑难重症的手术并发症，提高了手术成功率。