新余市中医院肛肠科建设有30余年历史，2003年纳入江西省重点专科建设单位，2006年验收，成为江西省第一批重点中医专科之一。本科室设有床位30张，年收治病人800多人次，拥有多功能综合肛肠治疗仪、电子结肠镜等诊疗设备，以满足临床工作需要；科室有专科医生4名，中医类别执业医师占100%，其中正高1人，中级3人，硕士研究生2人，江西省名中医1人，中华中医药学会肛肠分会理事1人，江西省中医肛肠学会副主任委员1人，江西省中医药学会肛肠分会委员3人，在专科发展中，重视发挥祖国医学治疗肛肠疾病的特色优势，并结合现代医学的技术成果，中医治疗率＞60%，优势病种中医治疗率＞70%，中医辨证论治准确率达到100%，确立了以混合痔手术方法的改良、肛肠疾病的外治法的临床研究为主要研究方向，并将成果应用于临床，以提高中医临床疗效。目前开展手术有：内痔注射术、混合痔外剥内扎术、肛裂切除术、肛瘘切除术、肛周脓肿一次性根治术、直肠脱垂经肛门手术、直肠息肉切除术等。2015年新开展无痛肛肠手术，患者在术中、术后排便、换药过程中肛门疼痛有了明显改善。近几年，科技发展不断提高，出院人次，业务量每年以30%以上的速度增长，区域外住院病人逐年增加，达20%以上，本专科已成为江西省同类学科中影响较大的科室，其影响力辐射到新余市周边地区。目前本科室已完成省级课题2项，市级课题2项，近几年在省级以上期刊发表论文10余篇。