小儿普通外科专业组创建于1956年，由王文华主任牵头组成。小儿普外专业是国内儿科医院中最早建立的专业之一，经过几代小儿普外人的努力，发展成为华南、中南地区最大小儿普通外科，全国8大小儿外科国家临床重点专科之一。复旦医院排名：全国小儿外科第2名，华南地区小儿外科排名连续5年第1名。目前科室有病床146张，配有设备先进的功能诊断室，年门诊量约12万人次，年手术量约1万台，日间手术率54%，50%以上患者来自省外，住院患者四级手术率60%，手术成功率高达99%。小儿普通外科专科特色诊疗项目介绍：最早开展微创技术，并应用于复杂先天性消化道畸形诊断及治疗的团队之一；国内率先研究小儿肝移植的团队之一；开展ECMO辅助手术。主要收治的病种有：急性肠梗阻、急性阑尾炎、急性肠套叠、梅克尔憩室、先天性巨结肠、先天性胆总管囊肿、胆道闭锁、门静脉高压、先天性直肠肛门畸形、先天性食管闭锁、先天性肠闭锁、神经母细胞瘤、畸胎瘤、肾母细胞瘤及肝母细胞瘤等。本专科目前下设新生儿与胎儿外科、普通外科、肿瘤外科和外科实验室等亚专科，业务发展方向主要集中在下列6个方面：（1）复杂型先天性畸形的诊治技术：在现有的小儿先天性畸形诊疗基础上，进一步开展如联体畸形、食道闭锁、腹膜后神经母细胞瘤、全结肠型巨结肠、胆总管扩张症、肝母细胞瘤、一穴肛等复杂型先天性畸形，提高的诊疗水平。（2）胎儿医学中心与胎儿外科手术：对产前筛查发现有先天性畸形的胎儿进行全面诊断、评估、跟踪、治疗和随访；已开展产时手术，在此基础上开展胎儿外科手术。（3）腔镜诊疗技术：腹腔镜、胸腔镜等诊疗技术在各亚专科得到广泛运用，已开展腹腔镜胆总管囊肿根治术、腹腔镜辅助巨结肠根治术、复合外伤的腹腔镜探查与治疗、胸腔镜下新生儿食道闭锁手术、胸腔镜膈疝修补术、腹腔镜肠旋转不良Ladd术等较为复杂微创手术，在此基础上进一步推进微创技术，建立华南小儿微创诊疗和培训中心。（4）器官移植：在与中山大学合作进行小儿肝脏、小肠肾移植的基础上，独立开展上述手术。（5）危重疑难病例的综合救治：建立小儿外科疑难及危重症救治中心，将进一步完善的小儿外科疑难、危重转运网络和救治体系，负责华南乃至全国的小儿外科疑难、危重病例的会诊、转运、综合救治和康复等。（6）先天性畸形实验研究方面：在现有膈疝、食道闭锁、肿瘤等的基础与临床研究基础上，进行胆道闭锁、神经母细胞瘤、肺动脉高压等疾病的基础和临床研究，申请国家自然基金项目。设有专门的受试者接待室、GCP办公场所，配备有药物储存柜、档案柜、试验药物冷藏柜，有完备的急救床单元、监护设备、抢救车及抢救药品，有训练有素的专业急救队伍。